中国铁路部门的层级结构如下：
铁道部（省部级）：最高级别，负责全国或省份内的铁路建设和运营，统筹协调各级部门的工作。
省部级：省级层面，根据省部级指示和规划，负责省内的铁路管理和发展工作。
铁路局（市或县三级）：省级铁路管理机构，负责省内外的铁路基础设施建设和维护，制定铁路运行计划。
机务段（县处级）：基层单位，主要负责铁路运输系统的车辆管理和设备维护。
这种结构确保各层级协调一致，共同推动铁路事业的发展。