要计算火车的运行时间，可以按照以下步骤进行：
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明确出发时间和到达时间：
- 出发站：宾阳站D381111：16:06
- 到达站：弥勒站：19:31
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计算从出发到下午17点的时间间隔：
- 16:06 到 17:06 是 1小时
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计算从下午17点到19:31的时间间隔：
- 17:06 到 18:06 是 1小时
- 18:06 到 19:31 是 1小时25分钟
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总计运行时间：
- 1小时 + 1小时25分钟 = 2小时25分钟
因此，火车的运行时间为：
[ \boxed{2 \text{ 小时 } 25 \text{ 分钟}} ]