不经过靖江。途经徐州、睢宁、宿迁、泗阳、淮安、建湖、盐城等县市，全线共徐州东站、后马庄站、双沟站、睢宁站、宿迁站、洋河站（预留站）、泗阳站、淮安东站、朱桥站、阜宁南站、建湖站、盐城北站、盐城站13座车站。
可是，《2015年度推动长江经济带发展重点任务分工方案》提及的沪泰宁城际轨道交通工程是江苏规划的中期实施项目，预计2020年之前开工，工期不超过4年。该城际轨道以南京为起点、上海为终点，途经仪征、扬州、江都、泰州、泰兴、靖江、南通7个城市，整体走向和宁启铁路较为接近。沪泰宁城际轨道交通工程的设计时速为250公里/小时，江苏省境内的里程共计250公里左右，粗略计算下来，从南京搭乘沪泰宁城轨最快不到2小时就能到达上海，和乘高铁的时间相近。