过闸后车费将自动扣除。
一、以上海地铁为例：
首次使用的用户，只需下载安装metro大都会手机app，在登录时选择用支付宝免注册登录，根据页面提示，依次在实名认证环节选择支付宝，在绑定支付方式环节选择支付宝先乘后方式，开通乘车
功能后，系统会自动生成上海地铁乘车二维码。进站时，乘客在标有刷码过闸，或本闸机支持保通卡和刷码过闸字样的闸机上，扫一下乘车码就能进站。出站时，再次出示乘车码在闸机上扫一下即
可出站，过闸后车费将自动扣除。
二、以深圳市为例：
深圳通乘车码支持先乘车、后付款、先充值、后乘车模式。持码人先通过深圳通APP等线上渠道给深圳通账户充值，扫码乘车后，深圳通系统从深圳通账户中扣取车资。深圳通乘车码定时自动更
新，不得重复使用。受网络等条件的影响，深圳通乘车码乘车可能出现扣费滞后现象。如影响换乘优惠的判断，深圳通系统将重新分析乘车数据，并在乘客下次扫码乘车时进行车资抵扣。
(3)上海地铁刷码过闸要打开流量吗扩展阅读：
乘车码的相关要求规定：
1、补登完成后，系统将根据补登的站点信息进行审核，并扣取应交车资，如逾期未补登，系统将按照轨道交通线网最低票价金额扣取车资。
2、 持码人需确保已开通深圳通乘车码的手机终端，可正常完成整个乘车行程。如果无法出示，持码人有义务配合运输企业核实乘车记录，并按规定支付相关乘车费用。