圳地铁1号线续建（世界之窗站—深圳机场站，2004—2008年）
罗湖站→国贸站→老街站→大剧院站→科学馆站→华强路站→岗厦站→会展中心站→购物公园站→香蜜湖站→车公庙站→竹子林站→桥城东站→华侨城站→世界之窗站（以上为一期站点）→白石洲站→科技园站→深大北站→南山医院站→前海路站→深圳西站→南头车辆段站→新安路站→宝安中心站→宝安体育中心站→西乡码头站→西乡中心站→固戌站→后瑞站→深圳机场站
深圳地铁1号线续建工程线路全长23.333km，其中：地下线18.14km，地面线0.415 km，高架线4.778km。新设13座地下站和2座高架站共15座车站。其中深圳西站为1号线与11号线换乘站，深圳机场站为1号线终点站。投资估算103.95亿元。计划2008年底建成。
深圳地铁2号线（蛇口西站—世界之窗，2004年底—2010年）
蛇口西站→蛇口客运港站→海上世界站→南水路站→招商东路站→工业八路站→登良路站→南山商业中心站→科技园站→沙河东路站→世界之窗站
深圳地铁2号线工程全长14.35公里，除1.25公里地面线外，其余均为地下线。全线设11座，其中地下站10座，地面站1座。世界之窗站为1号线与2号线换乘站。沿线穿过蛇口老城区、规划填海发展区、高新技术园区和世界之窗旅游景区。投资估算55.9亿元。计划2010年建成。
深圳地铁3号线（红岭中路—龙兴街站，2005—2009年）
红岭中路站→老街站→东门中路站→人民医院站→田贝路站→布心站→布吉联检站→布吉客运站→布吉镇政府站→汇福花园站→丹竹头站→育马场站→塘坑站→新世界广场站→银海市场站→爱联学校站→吉祥路站→龙城广场站→龙兴街站
深圳地铁3号线工程全长32.913公里，其中：地下线6.92km，地面线0.28 km，高架线25.713km。设站19座，其中6座地下站和13座高架站。其中老街站为1号线与3号线换乘站。投资估算98.86亿元。计划2009年建成。
深圳地铁4号线续建（少年宫—龙华镇中心，2004—2008年）
皇岗站→福民站→会展中心站→市民中心站→少年宫站（以上为一期站点）→莲花北站→梅林站→梅林检查站→白石龙站→龙华火车站→龙华中心站→上塘站→龙华镇中心站→龙华新城中心。
深圳地铁4号线续建工程线路全长15.953km，其中：地下线4.551km，地面线1.15 km，高架线10.252km。设2座地下站，1座地面站和6座高架站，共9座车站。其中会展中心站为1号线与4号线换乘站。投资估算59.3亿元。计划2009年建成。
深圳地铁11号线（深圳西站—塘坑，2006—2010年）
深圳西站→建工村站→西丽站→龙珠站→塘郎站→龙华站→板田站→雪岗站→上李郎站→平湖站→北通道站→塘坑站
深圳地铁11号线全长38.227km，设1座下沉式车站，3座高架站和8座地面站，共12座车站。11号线利用已有平南铁路改造。投资估算51.53亿元。计划2010年建成。
地铁5号线
前海湾站 、临海路站 、宝华路站 、宝安中心站、翻身站、
灵芝公园站、大浪站 、同乐站 、深职院站 、西丽站、
红花岭站 、大学城站 、塘朗站 、长岭陂站 、龙华火车站、
民治站 、五和站 、坂田站 、大埔站 、上水径站、
下水径站 、布吉中学站、布吉客运站、百鸽笼站 、布心站、
太安站 、怡景站 、黄贝站 、文锦站 、人民南站、大剧院站
p.s. 2006年12月30日 深圳商报
受到市民广泛关注的地铁5号线线路走向和站点设置初步方案昨日公布，并面向社会广泛征求意见。按照该方案，5号线自前海湾站引出，经龙华、布吉、罗湖，终止于大剧院站。全长约42.6公里，拟设31个站点。
市规划局有关负责人表示，此次展示方案为5号线初步方案，随着下一步工程可行性研究以及各阶段设计工作的深入开展，其线位站、敷设方式、站名等还将进一步优化调整。
据了解，方案展示地点为规划大厦一楼规划展厅、设计大厦一楼规划展厅、规划局宝安分局一楼展厅、规划局龙岗分局一楼展厅四处。市民也可登录深圳市规划局网站（ww．szplan．gov．cn）浏览，并提出相关意见。公示时间截止日期为2007年2月5日。
地下和高架相结合
该方案提出5号线的初步规划线路从前海湾站引出，沿临海路、宝华路西侧绿化带、创业路穿广深高速公路后，向东沿留仙大道经西丽至福龙路立交南侧，跨平南铁路，并沿平南铁路经龙华火车站至四季花城西北角，然后向东拐入布龙路，沿布龙路、吉华路穿广深线、深惠路，经百鸽笼片区往南拐至东晓路，然后穿越大头岭公园，沿怡景路、沿河路，最后折向深南东路终止于大剧院站。线路全长约42.6公里，设站31座，平均站距1.4公里。
其中5号线 分别被 中铁2局 和中铁隧道股份中标
3号线被 中铁5局中标
1