上海地铁和公交公司一样，属于上海城建（城市建设）部门管理。由上海市政工程部门主管的，运营则由上海申通地铁集团有限公司负责。
上海轨道交通，又称上海地铁，其第一条线路上海轨道交通1号线于1993年5月28日正式运营，是继北京地铁、天津地铁建成通车后中国大陆投入运营的第三个城市轨道交通系统。上海轨道交通由上海申通地铁集团有限公司负责运营，按照上海市物价主管部门批复的轨道交通网络票价体系计价，有多种票价优惠情况和车票种类。上海轨道交通的标徽由字母S和字母M变形组合，吉祥物是来自未来的小机器人畅畅。
截至2014年12月28日，上海轨道交通共开通线路14条（1-13号线、16号线），全网运营线路总长548公里，车站337座。（不含上海磁浮示范运营线，3/4号线共线段9个车站的运营路程不重复计算，多线换乘车站的车站数分别计数）在2015-2020年规划中，有5条线路延伸规划、4条线路新建计划。