7号线：中国水利水电建设股份有限公司。
9号线：大部分为中国建筑股份有限公司，小部分为深圳市市政工程总公司（9102/9702标段）
11号线：中国中铁股份有限公司。
深圳地铁9号线的重要事故
2014年11月19日，记者接业主报料，称小居大面积塌方，旁边就是小学存安全隐患。记者到现场了解内坍塌情况。被容保安制止：“公共场合不经允许也不能拍照”，并被保安拖出。中建南方公司负责宣传人士表示，已对塌陷地方注浆，地面已恢复。
2014年11月20日，深夜十时许，深圳地铁九号线施工打隧道时导致罗湖滨苑小区路面塌陷，塌陷深度一米左右，面积大约二三十平。记者在警戒线外采访时被工地保安无端拖出，被警方制止后保安消失不见，现场一位负责人先进行了道歉。