杭州复地铁集团
杭州市地铁集团有制限责任公司成立于2002年06月，主要从事轨道交通工程建设、营运与管理、房屋拆迁服务、房地产开发等。公司性质为杭州市政府直属企业，由杭州市、萧山区、余杭区、滨江区、钱江新城管委会、杭州经济技术开发区等6个投资主体共同出资。
杭港地铁公司
系杭州市属大型企业杭州地铁集团有限责任公司与香港知名上市公司香港铁路有限公司在杭州共同组建的中外合作企业。股权共归双方所有，其中杭州市地铁集团全资拥有的杭州地铁1号线投资有限公司占51%股份，香港铁路有限公司全资拥有的港铁地铁1号线投资有限公司占49%股份。2012年9月28日，杭州市政府与杭州杭港地铁有限公司签署地铁1号线特许经营协议，特许经营权为25年。
目前，杭州地铁1号线由杭港地铁有限公司运营管理；2号线、4号线由杭州地铁集团运营分公司运营管理。