武昌来火车站是地铁自4号线一期工程的终点站，为地下两层岛式车站。目前，地下一层站厅共设置A-D4个出入口，其中，B出入口连接中山路地下通道，前往武昌站西广场，C出入口则衔接武昌站地面西出站口。在站厅B和C出入口之间，共安装有16台自动售票机，方便大流量乘客同时购票。
乘客下火车从地面西出站口验票出站后，向右前方步行约100米，到达地铁C出入口，然后下到地下一层站厅，整个换乘过程需要从地面下到地下二层。
而乘客出地铁站换乘火车的话，从C出入口到达地面后，须先乘自动扶梯上到火车站2楼，然后从西进站口验票、安检进站，才能进入候车区；同时，乘客还可以从B出入口进入中山路地下通道，然后乘扶梯上到地面西广场，再上2楼进站。
从地铁地下二层站台进入2楼火车站西进站口，需要上至少3层楼才能完成换乘，换乘时间10到15分钟。