1、一号线沿线充值网点
充值网点：迈皋桥、红山动物园、南京站、玄武门、张府园、三山街、中华门、花神庙、南京南站、双龙大道、竹山路
综合业务点：新模范马路、鼓楼、珠江路、新街口、安德门、河定桥、百家湖、龙眠大道
2、二号线沿线充值网点
充值网点：马群、孝陵卫、明故宫、莫愁湖、元通
综合业务点：学则路、西安门、新街口、汉中门、兴隆大街
3、三号线沿线充值网点
充值网点：南京站、南京南站
综合业务点：天润城、卡子门
4、十号线沿线充值网点
充值网点：奥体中心、元通、小行
综合业务点：文德路、南京工业大学、安德门
5、机场线S1号线沿线充值网点
充值网点：南京南站
综合业务点：翠屏山、禄口机场
6、宁天线S8号线沿线充值网点
综合业务点：泰山新村、大厂、雄州、方洲广场
充值点不光提供充值服务，还可以直接购买充值卡。
南京地铁票制按里程计价，起步价2元可乘10千米，10千米以上部分，每1元晋级里程为6、6、8、8、10、10、12、14千米。 详细票价查询可访问南京地铁官网。
南京地铁实行低票价策略，从首条线路正式运营起南京地铁票价为中国最低，按国际地铁协会统计的购买力衡量，南京地铁票价属亚洲最低，按乘距衡量票价在全球排名末位。
一号线、二号线、十号线充值时间为：8:00-11:00；11:30-18:30；三号线、机场线、宁天线充值时间为：8:00-11:30；12:00-17:30。
综合服务点提供充值、售卡、学生卡办理和年检、过期卡激活、记名卡挂失、市民卡开卡等业务，服务时间为：8:00-11:30;12:00-17:30。
限期计次卡：是南京地铁每逢节假日或者南京地铁运营纪念日发行的一定面值的储值卡，限制在一定的日期前使用完，并且每次乘坐不分乘坐里程长短一律2元或者3元。
乘坐南京地铁可使用单程票或金陵通，使用金陵通的乘客将获得9.5折的优惠，使用金陵通学生卡乘客将获得5折的优惠。
全部车票有效时间均为300分钟，若300分钟后仍未出站，则需补交线网最高票价（金牛湖站-高淳站15元）。