2015年4月1日南京地铁3号线正式开通运营，目前有林场站、星火路站、东大成贤学院站、泰冯路站、天润城站、柳洲东路站、上元门站（暂缓开通）、五塘广场站、小市站、南京站、南京林业大学·新庄站、鸡鸣寺站、浮桥站·华海3C广场、大行宫站、常府街站、夫子庙站、武定门站、雨花门站、卡子门站、大明路站、明发广场站、南京南站、宏运大道站、胜太西路站、天元西路站、九龙湖站、诚信大道站 、东大九龙湖校区站、秣周东路站共计29个车站。
目前可以在南京站、南京南站与地铁1号线换乘，在大行宫与地铁2号线换乘，在南京南站与S1号线换乘，在泰冯路站与S8号线换乘。