杭州地铁5号线工程线路全长53.4公里，全为地下线，设车站38座，其中换乘站15座，设5号线车辆基地内容1座(仓前车辆基地)、停车场1座（萧山停车场），控制中心共享地铁1号线建华控制中心。主变电站除利用1号线火车东站主变外，新建主变电站2座（三坝村站、江南大道站附近）。
西起老余杭，经仓前街道（余杭区）、三墩街道、浙大紫金港、申花（西湖区）、桥西、拱宸桥街道（拱墅区）、运河商贸中心、石桥街道、东新街道、和平广场（下城区）、艮山门、经建国路至城站火车站枢纽，再沿江城路转望江门（上城区）、雄镇楼、至飞云江路口，经隧道过江，至滨江区江南大道，沿长河路至长河街道（滨江区），再转向滨康路、新汽车南站，沿金城路、人民广场（萧山区），至杭州火车南站枢纽，往东至新街镇
杭州地铁5号线的建设规划
广大市民关心的杭州城市轨道交通建设规划(2013-2019年)，在报送国务院批准同意后，国家发改委于6月20日正式予以批复。昨天，市政府召开新闻发布会，发布《杭州市城市轨道交通近期建设规划(2013-2019年)》。
5号线一期初设36个站点，其中重点站为：火车南站（换乘11、13号线）、人民广场站(换乘2号线)、滨康路站(换乘1号线)、江南大道站(换乘6号线)、南星桥站（换乘4号线）、城站(换乘1号线)、江城路站（换乘7号线）、建国北路站(换乘2号线)、打铁关站(换乘1号线)、东新园站（换乘8号线）、沈半路站（换乘3号线）、宝善桥站、莫干山路站（换乘10号线）、三坝村站（换乘2号线）、蒋村站、杭师大站、科技岛站。
地铁5号线向西在余杭预留临安城际接口，向东在萧山预留绍兴城际接口。