地铁在抄地下二层，下高铁后顺着人群袭下到地下就可以看到乘地铁1号线的标识，顺着标识走就可以了，距离有点点远哦。南京南站地下负二层，共将联结南京地铁1号线、南京地铁3号线、南京地铁S1号线以及南京地铁S3号线，与南京站一样，上下出口直接换乘。南京南站地面一层为换乘广场，广场中心区域就是地铁的进出站口;南北两侧为公交上客区，东西两侧各设出租、社会车辆的上客区;
1、南京地铁1号线，可前往新街口、南京站等。
2、南京地铁3号线，可前往夫子庙、浦口区等。
3、南京地铁S1号线，可前往江宁经济开发区、禄口机场等。
南京地铁一号线站点
目前，南京建成的地铁一号线只其中的一部分，也就是一期工程。
南京地铁一号线现全长21.72公里，其中地下线14.33公里，地面及高架线7.39公里，项目总投资85亿元。由迈皋桥至奥体中心，共16站，其中地下车站11座，地面及高架车站5座。乘坐地铁除了使用公交"一卡通"外，乘客还可以在地铁站现场购买单程票。现场购票分自动售票和人工售票两种。
全程线路：迈皋桥—红山动物园—南京站—新模范马路—玄武门—鼓楼—珠江路—新街口（与2号线换乘）—张府园—三山街—中华门—安德门—小行—中胜—元通（与2号线换乘）—奥体中心来规划
根据规划，一号线还将北延至燕子矶，南延至中国药大，西延过江至城西路，地铁10号线建成后，安德门至城西路段将并为地铁10号线。一号线全线总里程将达到41.8公里。
未来全程线路：迈皋桥—红山动物园—南京站—新模范马路—玄武门—鼓楼—珠江路—新街口—张府园—三山街—中华门—安德门—天隆寺—软件大道—花神庙—高铁南京南站—双龙大道—河定桥—胜太路—百家湖—小龙湾—竹山路—天印大道—经贸学院—南京交院—中国药大
地铁一号线将缓解南京日趋拥挤的城市交通，改变城市客运格局。地铁一号线将在巩固新街口商圈功能地位的同时，提升夫子庙、湖南路等地区、旅游景点的交通功能。此外，地铁线路的开通也是拉伸城市框架的好机会。
北延线：燕子矶－吉祥庵－晓庄－迈皋桥