一号线：燕子矶（未开通）-吉祥庵（未开通）-晓庄（未开通）-迈皋桥-红山动物园-南京火车站-新模范马路-玄武门-鼓楼-珠江路-新街口-张府路-三山街-中华门-安德门-天隆寺-软件大道-花神庙-高铁南京南站-双龙大道-河定桥-胜太路-百家湖-小龙湾-竹山路-天印大道-经贸学院-南京交院-中国药科大学
二号线：油坊桥-雨润大街-元通-奥体东站-兴隆大街-集庆门大街-云锦路-莫愁湖-汉中路-上海路-新街口-大行宫-西安门-明故宫-苜蓿园大街-下马坊-孝陵卫-钟灵街-马群-金马路-仙鹤门-学则路-仙林中心-羊山公园-南大仙林校区-经天路
三号线（在建）：林场-火炬南路-泰冯路-金新村-浦珠路-滨江路-五塘村-干休所-南京火车站-新庄-市政府-浮桥-大行宫-常府街-夫子庙-长乐路-雨花门-卡子门-大明路-高铁南京南站-秦淮路-胜太西路-天园西路-九龙湖
四号线（规划）：珍珠泉-浦珠路-浦江-中保-西康路-北京西路-云南路-鼓楼-市政府-九华山-板仓村-樱花路-岔路口东-徐庄软件园-金马路-灵山-东流-青龙-桦墅-仙林东
五号线（规划）：方家营-建宁路-下关-盐仓桥-福建路-虹桥-山西路-云南路-五台山-上海路-朝天宫-三山街-夫子庙-大中桥-光华门-小天堂-七桥瓮-大校场-岔路口-城北路-上元大街-新亭路-竹山路-科宁路-诚信大道-双龙大道-清水亭-将军路
六号线（规划）：新生圩-新港开发区-万寿村-营园南路-长途东站-省经干院-富贵山-明故宫-光华门-大校场路-夹岗-高铁南京南站-景明佳园-正德学院-佛城西路-将军路-秣陵-禄口新城-禄口国际机场
七号线（规划）：仙新路-尧华门-尧华新村-丁家庄-万寿村-窑上村-王塘村-黄方村-城河村-福建路-古平岗-省委-清凉河-莫愁湖-沿河街-应天路-东青石-新城科技园-明基医院-雨润路-恒河路-双闸-天河路-西善桥
八号线（规划）：铜井-翔凤路-江宁镇-板桥南-洲南路-板桥-板桥北-西善桥-油坊桥-小行-凤台南路-中华门-雨花门-康安里-小天堂-告成村-双拜岗-沧波门-麒麟工业园-芝嘉路-麒麟镇-灵山-仙林正中-仙林-仙新路
九号线（规划）：长途东站-曹后村-南京火车站-金桥市场-城河村-大桥南路-下关-农贸中心-定淮门-中保站-管子桥-汉中门大街-鼓楼科技园-清河路-绿博园
十号线（规划）：安德门-小行-中胜-元通-奥体中心-松花江西路-绿博园-江心洲-滨江大道-珠江东站-工业大学-凤凰大街-城西路-华山路-江浦站-三合村-明因寺-桥林-林山
十一号线（规划）：虎桥路-行知路-珠江南-森林大道-珠江东站-七里河-浦江站-浦江东-新马路-柳州路-大桥-大桥北路-泰冯路-沿江镇-盘城-大厂西-大厂-大厂东-长芦南-长芦-六合区政府-雄州-凤凰山公园-六合火车站
十二号线（规划）：黄里-桥林-林东-滨江村-生态科技园-红河路-运河路-黄河路-恒河路-油坊桥-兴梅路-春江新城-铁心桥大街-景明佳园-高铁南京南站
十三号线（规划）：乐山路-管子桥-嫩江路-清凉山-广州路-五台山-珠江路-浮桥-马标-明故宫-月牙湖-后标营-长巷-胜利村-杨庄-白下科技园-大里墅-大里村
十四号线（规划）：新路-新生圩-玉带-陈家庄-灵岩山-雄州东路-雄州-雄州西路-机场路-六合机场
十五号线（规划）：经天路-仙林东-白象-栖霞站-宝华-龙潭站-保税物流中心
十六号线（规划）：东流站-侯家塘-汤泉-汤山-万安-上峰
十七号线（规划）：马群-湾营路-麒麟工业园-定林-建南-南庆-大里墅-上坊工业园-万安路-上坊-文靖路-金箔路-成山路-新亭路-杨家圩-胜太路-胜太西路-静淮街-正德学院