1号线: 罗湖 → 国贸 → 老街 → 大剧院 → 科学馆 → 华强路 → 岗厦 → 会展中心 → 购物公园 → 香蜜湖 → 车公庙 → 竹子林 → 侨城东 → 华侨城 → 世界之窗 → 白石洲 → 高新园 → 深大 → 桃园 → 大新 → 鲤鱼门 → 前海湾 → 新安 → 宝安中心 → 宝体 → 坪洲 → 西乡 → 固戍 → 后瑞 → 机场东
2号线：赤湾总站 → 蛇口港 → 海上世界 → 水湾 → 东角头 → 湾厦 → 海月 → 登良 → 后海 → 科苑 → 红树湾 → 世界之窗 → 侨城北 → 深康 → 安托山 → 侨香 → 香蜜 → 香梅北 → 景田 → 莲花西 → 福田 → 市民中心 → 岗厦北 → 华强北 → 燕南 → 大剧院 → 湖贝 → 黄贝岭 → 新秀
3号线: 益田 → 石厦 → 购物公园 → 福田 → 少年宫 → 莲花村 → 华新 → 通新岭 → 红岭 → 老街 → 晒布 → 翠竹 → 田贝 → 水贝 → 草埔 → 布吉 → 木棉湾 → 大芬 → 丹竹头 → 六约 → 塘坑 → 横岗 → 永湖 → 荷坳 → 大运 → 爱联 → 吉祥 → 龙城广场 → 南联 → 双龙
4号线: 福田口岸 → 福民 → 会展中心 → 市民中心 → 少年宫 → 莲花北 → 上梅林 → 民乐 → 白石龙 → 深圳北站 → 红山 → 上塘 → 龙胜 → 龙华 → 清湖
5号线: 前海湾 → 临海 → 宝华 → 宝安中心 → 翻身 → 灵芝 → 洪浪北 → 兴东 → 留仙洞 → 西丽 → 大学城 → 塘朗 → 长岭陂 → 深圳北站 → 民治 → 五和 → 坂田 → 杨美 → 上水径 → 下水径 → 长龙 → 布吉 → 百鸽笼 → 布心 → 太安 → 怡景 → 黄贝岭