目前深来圳地铁已开通四条线路包源括罗宝线（原一号线）罗湖至深大段、蛇口线（原二号线）赤湾至世界之窗段、龙岗线（原三号线）高架段及龙华线（原四号线）南段。
一期工程于2004年12月28日试通车运营。总计19个车站，总长21.866千米。
2009年9月28日，深圳地罗宝线续建工程首通段正式开通试运营，10月1日正式运营。1号线首通段包括白石洲、高新园、深大三站三区间，全长3.39公里。
直到2010年12月28日，蛇口线（世界之窗—赤湾）南段、龙岗线（草埔—双龙）北段已开通试运营。2010年新开通的线路长34千米。