一期
一期于2009年12月28日通车，共24个车站，分别是：滘口、坦尾、中山八、西场、西村、广州火车站、小北、淘金、区庄、动物园、杨箕、五羊邨、珠江新城、猎德、潭村、员村、科韵路、车陂南、东圃、三溪、鱼珠、大沙地、大沙东及文冲。一期线路全长31.9KM，24个车站，其中滘口及坦尾为高架车站，其余为地下车站。
滘口站是高架站，位于芳村大道西与双桥路交汇处，紧邻佛山市南海区。车站位于客运站上方，周边有芳桥苑、新世界逸彩庭园、龙湾广场、瑞安花园等大型居民住院宅群；翠竹苑插花艺术学校、省商业学校、德明小学等学校；佛山广佛路口客运站、广州滘口汽车站等珠三角交通枢纽。
坦尾站是高架车站，位于双桥中路（沙河公路上，双桥公园以北），呈东西走向。东面有双桥公园、双桥中学和海角红楼游泳场，西面有金半岛酒店等。目前主要以居民住宅、公园为主。周边物业情况为：西北有颇具规模的鱼塘；东北有有珠岛花园；东南有松洲中学、中国海关宝税分局。按照规划，站点东、南、西侧为综合发展区，南侧为新建居住区。坦尾将是5号线与6号线的换乘站。
中山八站位于中山八路与南岸路交汇处，线路为东西走向。中山八站为三层岛式地下站，设备站。负一层为五路线站厅，负二层全为设备区层，负三层为五路线站台层。共设三个出入口，目前开通B和D口，A口暂不开通。车站周边有琼州酒店，荔湖名苑、辉泮苑和富力广场等大型居民住宅群，广州市政协外语学校、中山八路小学和荔湾区外语职业技术学校等学校，青年公园和荔湾湖公园等。
西场站位于环市西路与东风西路高架桥之间的东风西路段，线路为南北走向。车站站厅为站厅、站台分离式岛式站台车站，西场站共设6个出入口。车站周边有湘荔酒店，和平南小区、和平新村等大型居民住宅群，广雅中学、工人体育场、荔教大厦、广东能泮电力建设有限公司也在此站附近。
西村站位于环市西路与西湾路交界处，线路呈东西走向，东面临管广州火车站、省汽车客运站、市汽车客运站、流花车站。商业方面有大型服装城、国际商业鞋城。南面与西村交接，有荔湾区第二人民医院、广雅中学。西面临近西场、和平新村，有好又多超市、富力环市西苑、富力国际鞋业商贸、环市西路小学。北面与西湾路黑山交接，临近同德围鹅掌坦、协和小学、协和高中、羊城西湾大厦。西村站为地下三层结构，地下一层为站厅及设备层，地下二层为车站设备层，地下三层为站台层。西村站共设4个出入口，分别是A、B、C、D口，因C口与商厦相连未建，所以暂时开3个出入口。
广州火车站地铁站是二号线、五号线的换乘站，位于广州市越秀区环市西路东侧，邻近流花路、站前路、省汽车站、瑶台、王圣堂、三元里、矿泉街、桂花岗。这里紧邻全中国铁路枢纽之一——广州火车站，广深铁路、京广铁路及广三铁路均交汇在此。服装、皮具、鞋业等大型批发市场在火车站附近应运而生。许多中东地区的外商都在这附近购买大量货物运回家乡进行销售。
小北站位于环市中路与麓景路、小北路交界处以东的环市中路路面下，沿环市中路方向布置。小北站附近地区高楼林立，车站的西北方有登峰宾馆、怡东大厦，东北方有惠州大厦、广东省电视中心、广视宾馆，西南方有北秀大厦，东南方有裕华大厦、金鹰大厦。小北站为明暗结合三层分离岛式车站，负一层为站厅层，负二层为站台层，共设有4个出入口。
淘金站位于环市东路与建设六马路相交处，为酒店商贸区，人流吸引量大。周边物业情况为：西北有白云宾馆、广东国际大酒店、市二十一中、友谊商店、广东电视台等；东北有世贸大厦、华侨新村、文化假日酒店、广州市财政学校等；西南有银证大厦、市政大厦、好世界广场、花园酒店等；东南有北方大厦、远洋宾馆等；远期该处有大型地下物业发展项目。按照规划该地区还将进一步改善周围环境，形成一个旅游商业广场。淘金站为地下四层结构，负一层为预留市政用地，负二层为站厅层，负三层为设备层，负四层为站台层。共设有2个出入口，分别为A口花园酒站、B口白云宾馆。
区庄站位于环市东路与农林下路交叉口。周边物业情况为：西面是汇华商务大厦、电子大厦、黄花岗剧院、高迅大厦、中侨大厦、东山广场、华山宾馆、嘉应宾馆、远洋宾馆、中山医眼科医院；南面有广州市公路局、广州嘉裕商务中心、冠怡大厦、广东华信中心、浦发银行；附近学校有农林下路小学、广东工业大学等。区庄分为北站厅地面二层、地面首层上夹层、地面首层、地下地层、地下二层、地下三层、电缆层、地下四层、站台层。共设2个出入口，分别为D、E口。该站将是五号线及六号线的换乘站。
动物园站位于越秀区天河路、环市东路与水荫路交汇、广州动物园南门的地底。地铁五号线原本是没有动物园站的，但应市民需求才在区庄站与杨箕站之间增设这站。不过，由于车站场地小，所以采用三层式设计，其中地下一层是大堂，地下二层和三层分别是不同方向路线的站台，二层的路线是往滘口站方向，三层的路线是往文冲站方向，跟香港港铁车站相似，以节省空间。此站可以满足动物园的休闲客流和环市路段（如粤海大厦、东环商厦、东兴大厦）及东风广场、锦城花园、水荫路、梅花路两侧住宅区的客流。动物园站共设有2个出入口，分别为B口东都大世美食街、C口新东方酒店。
杨箕站是一号线、五号线的换乘站，位于中山一路与梅东路交汇处，还有新开发的高尚生活小区和豪华会所。该地段交通相当便利，毗邻东风路，前接中山一立交，是一个去环市路、东风路、天河和广州大道的交通接驳站。周边的五羊新城、天河等地区均是休闲娱乐的集中地带。
五羊邨站位于寺右新马路与广州大道交叉西侧，呈东西走向。西边物业情况为：西北有五羊新城方、金桥大厦、美景大厦、新时代广场、广州铁路第一中学等；东北有南天广场、珠江新城的高层商务住区等；西南有江景大厦、兴华大厦、五羊中学等；东南有名门大厦、新大厦、远洋明珠大厦、鸿景大厦等。五羊邨站为地下三层结构，负一层为站厅层，负二层为设备层，负三层为站台层，共设有4个出入口。该站设有公厕。
珠江新城站位于华厦路与花城大道交叉路口处。珠江新城站是三号线与五号线的换乘站，三号线呈南北走向，五号线呈东西走向，站台呈十字形叠交。珠江新城站为地下三层结构，负一层为三号线和五号线的站厅层，呈十字形，负二层为三号线站台和五号线两端客流夹层，负三层为五号线站台层。共设有6个出入口。
猎德站位于天河花城大道与兴国路交叉路口下，西北为珠江新城综合商住区，东北为珠江公园，站点以南是猎德居住区。
潭村站位于天河区花城大道广州赛马场南侧地下，车站呈东西走向。东端邻站为员村站，西端邻站为猎德站。东面连接花城会展中心，东南方为华师附属南国实验学校，西北方为珠江公园，北面为赛马场。潭村站有A、B、C、D四个出入口，A、B口暂不开通。
员村站位于员村生活区内，周边有天河都市广场、员村综合市场，生活区内设施比较多源化且交通方便。人流以车站北边的都市广场附近小区和车站以南的出租屋为主，而车站西南方的人流则来自员村村民，而天河公园也在生活区大约15-20分钟的路程范围内。员村站为地下二层结构，岛式站台，负一层为站厅，负二层为站台，共设3个出入口。
科韵路站位于天河区科韵路路口东侧与黄埔大道中路交界，车站呈东西走向。车站东面有百安居装饰材料城、广州化工厂、广州昊天化学企业集团、骏景花园等；西面有天河区公安分局，员村街派出所、天骏装饰材料市场/石材城、御禾酒家；西北面有科韵路公交站场、广州市天河财政局、科韵大厦、五华大厦、天河软件园/科技园南门、佳都商务大厦等；西南面有美林海岸花园。科韵路站为地下二层结构，岛式站台，负一层为站厅层，负二层为站台层，共设2个出入口，A口和B口。
车陂南站位于黄埔大道与车陂路交叉口，是四号线与五号线的换乘站。四号线呈南北走向，五号线呈东西走向，站台呈T字形叠交。共设A、B、C、D四个出口，其中D口为预留口。公厕设在车站的出口处，是五号线上其中一座设有公厕的车站。
东圃站位于黄埔大道东，呈东西走向，站台为岛式站台设有2个出入口。车站东北面有天海花边有限公司，东南面有广州木材厂、广东正大康地有限公司，西南面有东圃竹木市场，西北面有飞扬羽毛球馆、广本东圃店。
三溪站位于黄埔大道东，共设2个出入口，分别是B和C口。附近有美林湖畔小区、鱼珠国际木材市场。
鱼珠站位于黄埔区黄埔大道东与茅岗路之间的鱼茅路内，将来是十三号线与五号线的换乘站。十三号线呈南北走向，五路线呈东西走向，站台呈十字形叠交。鱼珠站北面有茅岗立交桥；东南面有黄埔中医院；西南面有港务局住宅区、鱼珠煤场住宅小区、鱼木小区和鱼珠街派出所等。鱼珠站设有2个出入口，分别是C和D口。
大沙地站地处广州市黄埔区的繁华地带中心，是人流最集中的地方。车站位于黄埔区港湾路与大沙地西路交叉口附近，周边是黄埔传统中心街区，呈东西走向。车站东北面有广州市一二三中学、八十六中学；东南面有黄埔区派出所和裕港大厦；西面有港湾小学、港湾一村、黄金幼儿园；西北有广州医学院港湾医院和横沙村。设有5个出入口，暂时开通A、C口。
大沙东站位于黄埔丰乐中路、镇东路与大沙地东路交汇口东侧，地面有黄埔体育馆、黄埔区政府、黄埔区少年宫及多个住宅小区。大沙东站共设3个出入口，分别为A、C、D口。
文冲站是五号线一期东面的终点站/起点站，位于大沙东路和石化南一街相连的路段下，呈东西向布置。车站北面是文冲停车场、广石化中学和文冲中学，东侧为万科城市花园、石化生活区，西南面有文冲村、文冲小学，西北临管大沙镇。文冲站共设有3个出入口，分别为A、B、D口