不存在“高铁”和“动车”的区别——难道“高铁”就不是一种“动车”吗？难道“动车”就一定不是“高铁”吗？如果说“高铁”是G字头，那么福厦线现在也有相当数量的G字头（合福高铁跨线）在运行，那么它到底是“动车”还是“高铁”呢？这个问题显然不成立。
即使是现有的福厦铁路，就速度标准而言也是“高速铁路”。按照国际通行标准，所有时速达到250公里以上的新建铁路或者时速达到200公里以上的经过提速改造的既有铁路，不论它采用何种技术标准和运营模式，都可以被称为“高速铁路”，在这一问题上加入任何其他的判断标准、比如“高铁必须是客运专线”“高铁必须是无砟轨道”“高铁必须是G字头”等等，都是不合理的，只会是混淆视听。不论是现在的福厦线（设计250km/h，运营在2011年以前是250km/h，现在为200km/h），还是未来的福厦客运专线（设计350km/h，运营可能是300km/h），它们设计速度不同但都是高速铁路，都是“高铁”。
福厦线和福厦客运专线有什么不同？从设计标准看，福厦线兼容普通列车（目前就有厦门始发3对直达特快经厦门-莆田段运行）和货车（虽然实际上数量极少），福厦客专则顾名思义。福厦线设计速度只有250km/h，这限制了速度的进一步提升，福厦客专设计速度则有350km/h。两者的线位略有不同，福厦线经福州南-福清-涵江-莆田-仙游-惠安-泉州-晋江至厦门北，福厦客专则由福州经福州南-福清西-莆田-泉港-泉州南-晋江南-厦门北至漳州，部分车站是共用的并设有联络线，但也有一些是新建车站。福厦线是东南沿海客运专线（杭深线）的组成部分，福厦客专目前可视为合福高铁的延伸线，同时也是未来的沿海350客专的组成部分。
福厦线和福厦客专的分工是怎样的？如果未来福厦客专建成，可以预见多数长途动车组列车、特别是G字头列车会转移到客专运行以提升运营速度，福厦线的运能得到释放后会更多作为省内城际线使用、当然也可能会增加一些普速列车。