这个问题太大了，不同线路、车型，收入和成本结构也不一样，另外还有列车运行直接有关的变动成本，和间接有关的路网维护等固定成本的区别，成本是整个线路各个部门共同承担的，还有如何分配的问题，要深入研究的话，得考虑很多方面。
在现行的铁路垂直管理体制下，地方铁路局实行着收支两条线的运营方式，即运行经费、人员开支都来自于铁道部的拨款，而铁路局的收入全部上缴铁道部后，铁道部再按铁路局运营经费、收入返点比例进行重新分配。
你要一定想计算的话，收入好计算，你直接根据列车的各种座位和铺位数量，乘以价格就成。成本不好算。
有篇论文，《旅客列车运行成本及效益核算分析管理系统》，这里不好贴链接，你自己搜索下能看到。
或者你看下铁道部这两年公布的整体运营收入、成本和盈利数据。
高铁能赚钱吗
高铁想赚钱，可以啊，把沿线的普快一封，高铁当普快用，保证赚钱