不是同一个车站，二者主要区别是，车站地址不同、主要线路不同、车站规模不同，具体如下：
一、车站地址不同
1、温州南站
车站地址：温州市瓯海区潘桥街道。
二、主要线路不同
1、温州南站
主要线路：甬台温铁路、温福铁路、金温铁路。
2、温州火车站
主要线路：金温货线。
三、车站规模不同
1、温州南站
截止2020年，温州南站总用地面积190368平方米，站台规模为4台10线。
2、温州火车站
截止2020年，温州火车站总占地面积15万平方米，设有7个站台、13条股道。
温州南和温州火车站有什么区别么
是两个火车站，都可以到常州
温州站位于温州市鹿城区温州大道，是浙江金温铁道开发有限公司直属的“金温铁路”上的一等客运站，于1970年正式建成投入使用，是温州市交通行业最大的“窗口”单位之一。
温州南站位于浙江省温州市瓯海区，为甬台温铁路、新金温铁路的终点站和温福铁路的起点站，经停车次一律为动车/高铁列车。隶属中国铁路上海局集团有限公司宁波车务段管辖，现为一等站。2009年9月28日铁路温州南站开通。
(6)温州铁路南站扩展阅读：
温州站总占地面积15万平方米，主站房建筑面积3.6万平方米，每日开行从温州到成都东站、哈尔滨、北京、广州、汉口、贵阳站、南昌、南京站、阜阳、镇江、亳州、上海、杭州、金华等地16对列车，最高日开行旅客列车甚至达23对
温州南站连接甬台温客运专线（甬台温铁路），温福客运专线（温福铁路）和金温铁路。经停车次一律为动车/高铁列车。温州南站北可直达北京、南京、上海、杭州等地，南可直达深圳、厦门、福州等地，西可直达贵阳，长沙，南昌，武汉等地。