南疆线铁路是指接兰新铁路的吐鲁番为起点，经库尔勒至喀什，全长1500公里。吐鲁番至库尔勒475公里， 其中巴音郭楞境内鱼儿沟至库尔勒365公里。库尔勒至喀什1025公里， 其中巴音郭楞境内段库尔勒至琼库勒200公里。
1974年4月， 南疆铁路第一期工程吐鲁番至库尔勒段动工修建，国家共投入劳力8.4万人，各种车辆3600辆，各种机械 8000台，于1979年完成路基工程，1979年8月铺轨到库尔勒西站。1984年国家组织各方面专家学者论证确认，选线合理，设计适当，施工质量良好，对各项工程表示满意，国家同意验收。 1984年8月30日，在库尔勒火车站举行了正式通车典礼。
1996年4月南疆铁路第二期工程库尔勒至阿克苏段动工修建，国家投入劳力12万人，各种车辆5000余辆，各种机构万余台，于1997年完成路基工程，1997年4月20日正式铺轨。1998年11月 30日投入运营，全长500公里。
修南疆线铁路是巴音郭楞各族人民日夜盼望的事。1912年中华民国成立后，孙山中先生就用粗重的红笔划出了南疆线铁路。1927年中华民国政府又聘请瑞典科学家斯文赫定专门带着一支科考队，踏勘南疆线。当时的行动仅仅表现在纸上和腿上，并无一点儿实质性行动。
中华人民共和国成立后的第十个年头1958年，巴音郭楞人民在全国大炼钢铁，大办粮食，大修铁路的口号激励下，脑瓜子、肚肠子、臂膀子、腿杆子都有了大的热情和行动，要修建库尔勒至库尔楚地方铁路，全长74.21公里。1959 年底成立铁路工程指挥部，出动3700人，拖拉机一台，大车81辆，毛驴车21辆，毛驴子398头，大动土木，伐原木3700方，完成路基5640方，1961 年路基工程完工。1962年国民经济调整，巩固、充实、提高、撤掉了铁路指挥部、铁路停建。
现南疆线铁路已经开通了库尔勒─乌鲁木齐、库尔勒─吐鲁番、库尔勒─西安、库尔勒─连云港、库尔勒─阿克苏、库尔勒─喀什6趟对开客运列车，全年完成旅客发送量100多万人， 以优质服务完成货运发送量500万吨。筹措资金7000 余万元购置了国内先进科技产品──双层卧铺全列空调列车。连续6年开通了库尔勒─乌鲁木齐天鹅号豪华旅游对开列车。为了提高巴音郭楞人民的形象，把全部优秀列车员调整到库尔勒─西安、库尔勒─连云港对开列车上，备受全国人民和国际友人赞扬。
谁能知道中南疆铁路建设的区位因素
从自然角度说,南疆生态系统较脆弱,破坏后恢复难.再有多沙尘天气,不利于火车的运行及铁路的维护.塔克拉玛干等沙漠的分布也对铁路选线产生影响.昼夜温差大对铁路的寿命产生不利影响.有一点好处就是盆地内部地势平坦,地质条件单一,有利于修建.
从社会角度说,城镇的分布,绿洲及农业区的分布,科技要求和修建成本都对铁路产生影响