1、
济南植物园科普馆位于植物园东北处，占地350平方米，展览面积1000平方米，一楼主要展示濒危植物、市树、市花与中国十大名花科普知识；介绍植物生命、世界植物之最等内容。二楼以植物和动物标本展示为主。
2、
彩色植物园位于公园东南侧，面积约3.1公顷，集中展示随季节变化而呈现不同色彩的观花、观叶、观果类植物50余种，以色叶树种五角枫、榉树、银杏、黄栌、红枫、紫叶矮樱等植物为主体，配置以色彩鲜艳亮丽的时令花卉，如郁金香、波斯菊、硫华菊、百日草等，也有“活化石”水杉、银杏等植物。
3、
紫薇石榴园位于济南植物园知春路西侧，南邻彩色植物区，主要栽种石榴、紫薇的各类品种，有“翠微”、“银薇”、“白石榴”、“玛瑙石榴”、“月季石榴”等品种。植物园园区水面借用春、夏、秋、冬四季，从西向东依次为“春华”、“夏香”、“秋实”、“冬韵”四湖。春华湖在世界城韩国馆和银杏松柏园之间，是植物展览区面积最大的湖。
4、
海棠园位于秋实湖西北部，是济南植物园内海棠类植物集中展览区，面积约6000 平方米。唐朝《花谱》称海棠为“花中神仙”。蔷薇科苹果属、木瓜属的贴梗海棠、垂丝海棠、西府海棠、木瓜海棠等品种在海棠园均有栽培，另引进凯尔斯海棠、钻石海棠、高原之火海棠等33个品种的北美系列海棠新品360余株。
5、
樱花园位于樱苑北侧，东临海棠园，北接童乐园，主要栽培植物以樱花、樱桃的各种品种为主，如日本樱花、日本晚樱等，另有部分蔷薇科的其它植物。春季桃红樱粉，落英缤纷，深深浅浅融成一片，云蒸霞蔚。
6、
蔷薇园位于园区东北部，面积约2.8公顷，是早春赏花和春花类植物收集与展示的重要区域。园内集中展示山茱萸、腊梅、杏梅、榆叶梅、碧桃、月季、等蔷薇科的观花、观果类植物70余种。花期在3-5月份较为集中，多采用成片栽植，观赏效果极佳。
7、
牡丹园位于园区的北部，面积约1.4公顷，东临蔷薇月季园，集中展示毛茛科芍药属植物，栽植有牡丹151品种、芍药63品种，共计8000余株。牡丹园地形起伏，牡丹、芍药依势散置，更配以丹枫、白皮松增加四季景观。牡丹是我国特有的木本名贵花卉，4-5月开花，素有国色天香、花中之王的美称，长期以来被人们当做富贵吉祥、繁荣兴旺的象征。芍药具有“花相”之称。
8、
童乐园。位于南北主干道百合路中段西部，这是孩子们的天地，园内设计了许多适合儿童玩乐的游戏，使孩子们在玩乐中增长知识，还设计了比较安全的适合儿童游嬉的涉水池、沙滩、卵石滩等亲近自然的内容。
9、
木兰园。位于夏香湖与北主园路之间，主要以引种木兰科植物为主，每当早春，树叶未发，经春风的吹拂，春雨的滋润，木兰花如千万只玉鸟飞临枝头，玲珑瑞雪堆积树梢。玉兰不但花色美丽，还有幽幽清香。微风徐徐，芬芳缕缕，纯正宜人。
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松柏银杏园位于植物园的西边，建设中顺应山势，因高就低，采用起伏变化的地形和自然交错的植物种植手法，引种栽植以裸子植物为主的各种植物 20余种，同时为增加观赏效果配置了观花及观果植物10余种，营造出了壮观、自然的景观。
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竹园。位于夏香湖南面，是以栽培展示竹子为主的专类园，北侧建有竹博馆，竹林深处设置竹文化长廊。在我国的传统文化中，竹是“岁寒三友”，包含了中国传统道德的优秀品质：“上下有节显示忠心，同根共发是仁义，竹竿空心代表谦虚，狂风不倒更是非常坚韧不拔”。这里以展示竹类植物为主，引种栽培了刚竹、巴山木竹、紫竹等16个品种约28000株，绿筠万杆，郁郁葱葱。
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盲人植物园是特别为盲人设计的专用植物园，园内种植各类易于为盲人感知的植物，如芳香类植物（蜡梅、海棠、丁香等），叶型特殊类植物（银杏、马褂木、七叶树等）；枝干特殊类植物（柿树、龙爪槐、紫薇等）和果实特殊类植物（紫荆、金银木、五角枫等），其中有专供盲人“手读”的文字介绍牌和语音提示系统，即使盲人没学过盲文，也可以通过语音提示来了解植物。园内设置有盲道、扶手、标识牌、语音系统、无障碍休息平台、无障碍厕所等为盲人朋友服务的设施，说明标牌的附近，有不同花木可以触摸，还可以通过直接用手触摸来认识植物，使盲人能够发挥触、感、知、嗅、闻的代偿功能，以详尽了解各类植物的名称、特性和用途。
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菊园位于植物园南主园路中段北侧，主要展示菊科植物及宿根花卉，种植以百合科、景天科、石蒜科、菊科、鸢尾科等近百种宿根花卉，自春至秋花开不绝。每年一度的秋季菊花展是植物园的精品所在，可展出菊花约1000个品种，以及各种艺菊造型，场面宏大，精品荟萃，成为济南秋季赏菊花的好去处。菊园还种植了大片竹林、点缀了柿树、银杏等观果、观叶的乔木，这些植物与菊花及其它宿根花卉交相辉映，构成了四季可观赏游览的园地。
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夏香湖。占地面积1.8万平方米，湖内建有中心小岛，将水面划分成大小、深浅不同的水体空间，满足不同水深植物的生长需要。湖西岸建有高地花架长廊，南北长180米，长廊南段有双层仿古四角亭，北端有单层小亭。湖东岸建有930平方米的“葫芦广场”。