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结论：爱吾游戏宝盒玩奥特曼格斗进化3无法自定义键位。
解释原因：奥特曼格斗进化3是一款PSP游戏，而爱吾游戏宝盒只是一个模拟器软件，其模拟的是PSP游戏机的运行环境。但游戏本身并没有设置自定义键位的选项，因此在爱吾游戏宝盒中也无法进行键位调整。
内容延伸：虽然无法自定义键位，但爱吾游戏宝盒可以通过模拟器本身的按键映射功能来实现键位调整。例如，可以将模拟器的“上下左右”键映射为游戏中的“移动”键，将模拟器的“A、S、D、F”键映射为游戏中的“攻击”、“跳跃”、“必杀技”、“防御”等键位，以达到键位调整的目的。
具体步骤：
1. 打开爱吾游戏宝盒，选择游戏奥特曼格斗进化3，进入游戏页面。
2. 点击模拟器页面上方的“设置”按钮，选择“输入设置”。
3. 在输入设置界面中，可以看到模拟器默认按键映射的设置。
4. 点击需要修改的按键，例如“上下左右”键，进入修改按键的界面。
5. 在修改按键的界面中，可以选择需要映射的按键，例如选择“D键”来映射“右键”。
6. 修改完毕后，重复以上步骤，将需要映射的按键都进行设置完毕。
7. 点击“保存”按钮保存设置，重新进入游戏即可按照新的按键映射进行游戏操作。
需要注意的是，按键映射只是模拟器对按键的映射关系，游戏内的按键提示还是原来的按键。因此，在修改按键映射后，需要在游戏中多尝试操作几次，熟悉新的按键映射关系。