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在《汤姆·索亚历险记》的结尾，凶手的结局是被抓住并受到法律的制裁。在故事中，汤姆·索亚和哈克贝利·芬一起揭露了一起谋杀案的真凶，那就是镇上的酒鬼波特。波特在醉酒的状态下杀害了受害者，却被认为是自杀。汤姆和哈克通过调查找到了证据，最终揭示了真相。
在故事的结局部分，波特被抓获并受到法律的审判。由于汤姆和哈克的勇敢和智慧，凶手被绳之以法，正义得以伸张。这也展示了汤姆·索亚和哈克贝利·芬在面对邪恶和犯罪时的勇敢和正义精神。在小说中，这个结局意味着正义最终战胜了邪恶，为社会带来了和谐与安宁。